Socrates programından bahsederken bazen Socrates II dendiği de olmaktadır. Bununla, programın 1 Ocak 2000'den 31 Aralık 2006'ya kadar sürecek olan ikinci aşaması kastedilmektedir. Halen devam eden bu aşama, 1995-1999 arası dönemde uygulanan birinci aşamadan elde edilen tecrübelerle geliştirilmiştir. İkinci aşama için ayrılan bütçe 1.850 milyon Euro değerindedir.